BioJava -- La puissance de la technologie JAVA pour décrypter le génome

BioJava a été créé dans les années 95 par suite des besoins de Matthew Pocock et Thomas Down, deux étudiants en physique à l'institut Sanger de Cambridge (Angleterre). Leurs études portaient sur le projet du Génome Humain.

BioJava permet de convertir une séquence ADN à ARN, et traduire alors cette séquence en protéine.


Exemple :

import org.biojava.bio.symbol.*;
import org.biojava.bio.seq.*;
[...]
//create a DNA SymbolList
SymbolList symL = DNATools.createDNA("atggccattgaatga");
//transcribe to RNA
symL = RNATools.transcribe(symL);
//prove that it worked
System.out.println(symL.seqString());
//translate to protein
symL = RNATools.translate(symL);
//prove that it worked
System.out.println(symL.seqString());
Pr�c�dents
JavaSéminaire Sun Microsystems - Gatonero6/30/04
JavaUML 2 en action6/29/04
JavaLa fondation Eclipse invite Microsoft à se joindre au projet Eclipse6/29/04
JavaJava3D en open source6/28/04
SunSun prépare l'interface 3D6/28/04

 
Suivants
Java1 Cool Menu FX Tool - Générateur de menus en Java7/2/04
SunSun dévoile sa stratégie SOA7/2/04
JavaSortie de la nouvelle version du SDK Java de HP pour OS HP-UX , version 1.4.2.047/16/04
JavaDéveloppement SWING : TCBuilder est un outil d'aide au développement de GUI.7/27/04
SunSun envisage le rachat de Novell8/2/04




Retrouvez ci-dessous les autres sections du Laboratoire Sun
Evènements
Java Sun Net Talk LIVE CHAT le 2 Avril à 16h303/29/08
SolarisSunDécouvrez les nouveaux Sun Fire sous Intel10/11/07
JavaValtech Days10/9/07
JavaApacheCon du 1 au 4 mai à Amsterdam2/13/07

Exemples de code
JavaManipuler les looks and feel (lister et affecter)10/15/07
JavaFaire sa propre injection de dépendance avec les annotations5/9/06
JavaSplash screen avec progress Bar5/5/06
JavaFaire un splash screen en swing5/5/06

Articles
Eclipse Europa : le successeur de Callisto
Après Eclipse Callisto (Eclipse 3.2), la fondation Eclipse sort la nouvelle mouture d'Eclipse appelée Europa (Eclipse 3.3) faisant ainsi passer le nombre de projets embarqués de 10 à 21. Que ceux qui sont réticents aux « distributions » d'Eclipse se rassu12/21/07
JavaCruiseControl : l’outil d’intégration continue à avoir dans sa boite à outils
CruiseControl est un projet open-source offrant de multiples fonctionnalités pour l’intégration, que ce soit pour des développements Java ou .Net. Il est courant sur un projet d’être plusieurs développeurs avec des tâches de développement réparties. Dans7/2/07
JavaEJB3 - Des concepts à l'écriture du code - Editions DUNOD
Consulter le résumé du premier ouvrage du laboratoire Sun de SUPINFO : EJB3 - Des concepts à l'écriture du code. Guide du développeur, éditions DUNOD.5/27/07
JavaPassage de certification Java Web (SCWCD)
Passer une certification est toujours un moment important car cela permet de mieux faire reconnaître ses compétences face à un recruteur ou un employeur.5/12/07
JavaGoogle Web Toolkit
Google Web Toolkit est un framework java pour générer du javascript et des requêtes Ajax à partir d’un code java. Voilà comment il fonctionne.5/10/07
JavaJ2ME Vs SDE
Demain, les terminaux « légers » seront plus nombreux que les ordinateurs personnels, ce qui entraîne une bataille sur le choix d’une plateforme identique à tous ces terminaux… Aujourd’hui nous retrouvons le J2ME ainsi que le SDE qui s’offrent une rude b4/22/07

Laboratoire SUPINFO des technologies Sun
labo-sun@supinfo.com


Conditions d'utilisation et © Copyright 2000-2006 SUPINFO Paris, Paris Academy of Computer Science
23, rue de Château Landon - 75010 PARIS - Tél : +33 (0) 153359700 Fax : +33 (0) 153359701
Respect de la vie privée